鄂霍次克海天然气水合物区柱状沉积物LV39-18H微生物多样性研究

【摘要】： 冷泉是指温度接近于海水,而以高于周围水环境浓度的烃类化合物(主要为甲烷)、硫化物或二氧化碳为主要成分,受地质构造或压力梯度作用渗出沉积物表层的流体。对冷泉沉积物中微生物群落的调查,有助于认识该极端环境中某些生理未知微生物类群的功能并理解微生物活动对整个系统的影响。 本文对从鄂霍次克海冷泉区采集获得的沉积物样品按深度划分得到的11个断层中的6个断层进行了总基因组的提取,利用16S rDNA作为分子标记,构建克隆文库并结合总有机碳、总氮、硫等环境因子对该样品中的细菌和古菌群落结构沿沉积物断层的分布情况进行研究,结果显示该沉积物中的细菌和古菌均具有高度多样性且显示出明显的成层分布: 1.细菌群落主要来自10个细菌门,优势门类为绿弯菌、未定门JS1、γ-、δ-变形菌,同时还发现浮霉菌、未定门OP8、放线菌、酸杆菌、拟杆菌、疣微菌的存在。我们还在分布于表层沉积物δ-变形菌类群中发现了占该层群落15%以上的SRB(硫酸盐还原菌)类群,这强烈提示着该沉积物环境中存在着AOM(甲烷厌氧氧化)过程。 2.古菌类群主要划分为DSAG、MBG-D、MCG、MGI、MBG-A和MHVG等类群。其中MBG-D类群沿断层的垂直分布与沉积物中硫含量表现出相似的变化趋势,这提示MBG-D类群可能参与该环境中硫相关的地质化学过程。 【关键词】：冷泉沉积物 16S rRNA基因文库 微生物多样性 环境因子 鄂霍次克海
【学位授予单位】：中国科学院研究生院（海洋研究所）
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2009
【分类号】：Q938
【目录】：

• 摘要4-5
• Abstract5-8
• 第一章 文献综述8-27
• 1 海洋微生物与其在海洋生态系统中所扮演的角色8-12
• 2 海底冷泉微生物生态学研究进展12-18
• 2.1 微生物群落对于环境的影响及作用12-14
• 2.2 海底冷泉微生物多样性14-17
• 2.3 展望17-18
• 3 鄂霍次克海水文和地质特征与浅表层天然气水合物18-21
• 3.1 鄂霍次克海水文和地质特征18-19
• 3.2 浅表层天然气水合物19-21
• 参考文献21-27
• 第二章 鄂霍次克海沉积物细菌和古菌多样性研究27-62
• 1 材料与方法28-36
• 1.1 实验材料28-30
• 1.2 实验方法30-36
• 2 实验结果36-51
• 2.1 沉积物样品的地质化学特征36-37
• 2.2 对 16S rRNA 基因文库的统计分析37-38
• 2.3 古菌的多样性、群落结构与成层分布38-42
• 2.4 细菌的多样性、群落结构与成层分布42-48
• 2.5 对古菌 16S rDNA 序列的系统发育分析48-49
• 2.6 对细菌 16S rDNA 序列的系统发育分析49-51
• 3 讨论51-54
• 3.1 各断层微生物多样性的比较51-52
• 3.2 微生物群落沿断层的分布52-54
• 4 结论54-60
• 参考文献60-62
• 已经发表和完成的文章62-63
• 致谢63

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